Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc9Q8VC31 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc9Q8VC31 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms