Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnaaf4Q8R368 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnaaf4Q8R368 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms