Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms