Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ltbp4Q8K4G1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ltbp4Q8K4G1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms