Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OptnQ8K3K8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OptnQ8K3K8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms