Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap2Q8K389 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk5rap2Q8K389 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap2Q8K389 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms