Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncapd2Q8K2Z4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncapd2Q8K2Z4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd2Q8K2Z4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms