Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc12Q8K2L8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc12Q8K2L8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms