Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brd3Q8K2F0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd3Q8K2F0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms