Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcf3Q8K268 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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