Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms