Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prkd3Q8K1Y2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms