Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sde2Q8K1J5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sde2Q8K1J5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms