Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scnm1Q8K136 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scnm1Q8K136 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms