Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

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Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc5a11Q8K0E3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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Slc5a11Q8K0E3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Slc5a11Q8K0E3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Slc5a11Q8K0E3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Slc5a11Q8K0E3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Slc5a11Q8K0E3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Slc5a11Q8K0E3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Slc5a11Q8K0E3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Slc5a11Q8K0E3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Slc5a11Q8K0E3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a11Q8K0E3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms