Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms