Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf628Q8CJ78 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms