Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prmt5Q8CIG8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prmt5Q8CIG8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms