Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nupl2Q8CIC2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nupl2Q8CIC2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms