Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ep400Q8CHI8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ep400Q8CHI8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms