Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nav1Q8CH77 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nav1Q8CH77 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nav1Q8CH77 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms