Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbm28Q8CGC6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm28Q8CGC6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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