Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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