Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nrip1Q8CBD1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nrip1Q8CBD1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrip1Q8CBD1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrip1Q8CBD1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrip1Q8CBD1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nrip1Q8CBD1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms