Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn3Q8CBC6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms