Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fbxo48Q8CAT8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fbxo48Q8CAT8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms