Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BC049762Q8C601 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BC049762Q8C601 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms