Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ssxb2Q8C5Z3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ssxb2Q8C5Z3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb2Q8C5Z3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb2Q8C5Z3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ssxb2Q8C5Z3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb2Q8C5Z3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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