Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf428Q8C1M2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf428Q8C1M2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf428Q8C1M2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms