Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Strip1Q8C079 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms