Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm1Q8BXQ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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