Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Iffo1Q8BXL9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Iffo1Q8BXL9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Iffo1Q8BXL9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Iffo1Q8BXL9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Iffo1Q8BXL9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Iffo1Q8BXL9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Iffo1Q8BXL9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Iffo1Q8BXL9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Iffo1Q8BXL9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Iffo1Q8BXL9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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