Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt3Q8BXF8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms