Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmod1Q8BVA4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod1Q8BVA4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms