Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc5dQ8BV57 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc5dQ8BV57 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc5dQ8BV57 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms