Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrp12Q8BUJ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp12Q8BUJ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms