Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem87bQ8BKU8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem87bQ8BKU8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem87bQ8BKU8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms