Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc5a7Q8BGY9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a7Q8BGY9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a7Q8BGY9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a7Q8BGY9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a7Q8BGY9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a7Q8BGY9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a7Q8BGY9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc5a7Q8BGY9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Slc5a7Q8BGY9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Slc5a7Q8BGY9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Slc5a7Q8BGY9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc5a7Q8BGY9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc5a7Q8BGY9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Slc5a7Q8BGY9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Slc5a7Q8BGY9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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