Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2bQ8BG39 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2bQ8BG39 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms