Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp4Q8BFV3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dusp4Q8BFV3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms