Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Jmjd4Q8BFT6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Jmjd4Q8BFT6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd4Q8BFT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms