Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.2Q85ZW9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M10.2Q85ZW9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms