Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NfascQ810U3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms