Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc172Q810N9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc172Q810N9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms