Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Liat1Q810M6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Liat1Q810M6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms