Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prima1Q810F0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms