Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV3

Trrap, Transformation/transcription domain-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrrapQ80YV3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrrapQ80YV3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrrapQ80YV3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrrapQ80YV3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrrapQ80YV3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrrapQ80YV3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrrapQ80YV3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms