Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm5bQ80Y84 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5bQ80Y84 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms