Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttc28Q80XJ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttc28Q80XJ3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttc28Q80XJ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc28Q80XJ3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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