Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep170bQ80U49 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep170bQ80U49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep170bQ80U49 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms